Sâfî tefsir kitabının meselelerinin şecere biçiminde üç ana kol halinde sınıflandırılması: İsimler: Allah'ın sıfatları, Masumlar; Peygamberler ve salihler; rical; kadınlar; kurra; cin ve melek; semavî kitaplar; mekanlar; dinler; fırkalar ve kabileler; esbab-ı nüzul. Kur'an ilimleri: Mekkî sureler, Medenî sureler, Mekkî ve Medenî sureler, ayet ve sure isimleri, surelerdek ayetlerin sayısı, nâsih ve mensuh. Kavramlar: Vakalar ve günler, dualar, feyiz tefsirine dair görüşler, burhanlar ve reddiyeler, isimlendirme gerekçesi, fıkıh kavramları, edebî konular, senetler, mevzu rivayetler, fazilet rivayetleri, rivayetleri tenkit, kıraat, tefsir rivayetleri